Jono Pauliaus II krikščioniškųjų studijų centras savo ištakas siekia 1995 m., kai buvo įkurta Klaipėdos universiteto Pedagogikos fakulteto Katechetikos katedra. 2015 m. katedra reformuota į studijų ir mokslo centrą. Jame dirba šeši mokslų daktarai: profesoriai, docentai, mokslo darbuotojai.
Centro veiklos tikslas – kryptingai tyrinėti krikščionybės raišką teologiniais, edukaciniais, ekumeniniais ir kultūriniais aspektais bei vykdyti religijos mokslų studijas vakarų Lietuvoje.
Palaikomi tarptautiniai ryšiai su kitais Europos universitetais (Romos, Florencijos, Helsinkio ir kt.), dalyvaujama konferencijose, seminaruose, keičiamasi dėstytojais tarp institucijų, keliama profesinė darbuotojų kvalifikacija, publikuojamos monografijos ir straipsniai.
Centras kuruoja Dvasinio konsultavimo ir asistavimo magistrantūros studijų programą (trukmė 2 m.). Studijos vyksta nuolatine sesijine forma. Studijų programos tikslas – parengti dvasinius konsultantus/asistentus, gebančius šiandieniniame pasaulyje konsultuoti dvasinių krizių ir konfliktų, egzistencinių sunkumų bei problemų ištiktus žmones. Programoje dirba tiek teologai, edukologai, tiek psichologijos mokslo specialistai. Baigus studijas suteikiamas humanitarinių mokslų magistro diplomas.
